OLAH Germán. A veces pasa que extrayendo el USB sin desvincularlo mediante USB Stop puede dar problemas, pero no siempre ocurre esto.
Has probado con diferentes USBs??
También es extraño que deje de funcionar la conexión para tarjetas SD al mismo tiempo que el USB.
Técnicamente no sé si esto puede ocurrir, así que te aconsejo que hagas una consulta a tu tienda Pioneer DJ o al servicio técnico más cercano.
Take Care